En 2002 Calderón recaló en el Fuenlabrada, y fue tal su impacto que la selección absoluta le convocó para el Mundial de Indianápolis.
José Manuel Calderón jugó en el TAU Cerámica hasta el año 2005, último equipo antes de su llegada a la NBA
José Manuel Calderón debutó en la NBA en los Toronto Raptors, con los que llegó a jugar en play-off en los años 2007 y 2008.