Estos centros, según denuncian varias asociaciones del sector educativo, están asfixiados por los recortes de subvenciones por parte de las administraciones; en algunas comunidades autónomas sufren retrasos del pago en el abono de los gastos de funcionamiento; y además, cada vez tienen más problemas para cobrar las denominadas "aportaciones o donaciones voluntarias".
Por comunidades autónomas, el País Vasco es la comunidad con mayor porcentaje de colegios concertados, seguida a gran distancia de Navarra, Baleares, La Rioja y Cataluña.
Según la Organización de Consumidores y Usuarios, en el 91 % de los colegios concertados visitados se informa de la obligación de pagar algún tipo de cuota.
La OCU recuerda que la ley impide a los centros con financiación pública cobrar por la enseñanza obligatoria, por lo que su gratuidad debería estar garantizada para todos los alumnos.